Pada tahun 1994, Yayasan Wakaf Paramadina dengan ketua Prof. Dr. Nurcholish Madjid dan Yayasan Pondok Mulya, yang masing-masing bergerak di bidang pendidikan, bersepakat mendirikan sebuah perguruan tinggi.
Maka, pada 10 Januari 1998 berdirilah Universitas Paramadina Mulya, yang kemudian berubah nama menjadi Universitas Paramadina. Universitas Paramadina ini diharapkan mampu:

• Memperkenalkan konsep perguruan tinggi alternatif.
• Menghasilkan lulusan yang mempunyai kompetensi riset dan kewirausahaan yang dijiwai etika keislaman.
• Menjadi wahana pusat kebudayaan dan peradaban. Menjadi universitas yang bertaraf internasional.